故事主要讲述了女主角桃园奈奈生因好赌而欠债的父亲不知去向，被讨债的人赶出了家。在走投无路之时，她帮助了一位被狗追的懦怯的男人，得知她的遭遇后神秘的男人说出了「我把我的家转让给你吧。」这样出奇的话…

幕府时代末期，外忧内患，山河动荡，百姓生活困苦，且生命时刻受到威胁。少年心太因其善良纯洁之心感动飞天御剑流高手比古清十郎，被其收入门下学习剑法，更名剑心。　　在国家危难之际，年轻的剑心怀揣改变时代

　高中時期向青梅竹馬久美告白失敗的昭比古，考上大學理工科後，收到成為地下偶像的久美公演的邀請。然而，昭比古卻在公演結束後，看到久美與經紀人曖昧的肢體接觸。失意的昭比古決定與教授的情人合作組成研究小組，