《猪猪侠之南海日记 第二季》是猪猪侠全新番外科普系列动画片，讲述了超星特工猪猪侠和阿五结束恐龙世界的探险后，前往神秘的南海，调查海洋生物、完成记录的探险故事。

猪猪侠接到新任务，就是在神秘而美丽的南海搜集寻找各种海洋生物，调查并记录它们的生存环境和独特行为。为了保护海洋生态环境、记录大开眼界的见闻，猪猪侠与伙伴阿五、聪聪组成探险小队，不但要面对海底世界的种种困难，还要与一个叫坏坏博士的竞争者斗智斗勇。

英雄团耗尽了超星护符的能力，依然无法打败聂墨西斯。猪猪侠等人没有放弃，选择暂时撤退，去寻找修复护身符的办法。他们在蓝月星各处见识了缺水环境里水族居民的苦难生活，帮助他们解决了生存的难题。蓝月星人的感激与满足汇聚成最纯净的“生命之水”令护身符重生。众人通过历练彻底掌握了护符的能力，最终将篡夺了聂墨西斯力量的糕力击败，成功拯救蓝月星。

韦教授得到聂墨西斯的远古知识后，结合巨齿鲨和邓氏鱼的基因研究复活了一条远古大海兽——邓啃，并派遣邓啃去星海城消灭猪猪侠等人。但之前彪汉吞食海心碎片后留下了后遗症变得非常虚弱，彻底失去了战斗能力。剩下的鞭炮，龙卷，钢牙，坦克合力依旧不是邓啃的对手。为了保护无辜的平民，英雄团不得不暂时撤离星海城。

韦教授得到聂墨西斯的远古知识后，结合巨齿鲨和邓氏鱼的基因研究复活了一条远古大海兽——邓啃，并派遣邓啃去星海城消灭猪猪侠等人。但之前彪汉吞食海心碎片后留下了后遗症变得非常虚弱，彻底失去了战斗能力。剩下的鞭炮，龙卷，钢牙，坦克合力依旧不是邓啃的对手。为了保护无辜的平民，英雄团不得不暂时撤离星海城。

在美丽的猪猪星上，猪猪侠和菲菲、波比、小呆呆、超人强、迷糊来到海边享受美好时光的时候，一场突如其来的意外，众人被一只大海兽带到一个全新的海底文明蓝月星，并被告知蓝月星正面临灭顶之灾，还会殃及猪猪星。为了拯救家园，猪猪侠等人必须根据远古英雄的预言，去十二个不同的海域收集十二块海心碎片，恢复蓝月星的和平。

猪猪侠从小立志成为职业决竞球运动员，并梦想获得作为绝竞球手的最高荣耀——成为太阳之子。迷糊与猪猪侠相遇，并与小呆呆、菲菲组成一支决竞球队伍——小虎队。在一场场不同的比赛中，猪猪侠逐渐学会与队友磨合，不断进步形成自己的风格，也越来越深地体会到团队的力量。

超星联盟旗下的超星特工猪猪侠和菲菲、波比、小呆呆、超人强，在执行追踪星际盗贼团的任务中，进入了超星联盟尚未探索过的全新星域。猪猪侠和伙伴们在这里收获了重要伙伴超星卜卜们，也结识了不打不相识的神秘朋友奇迹。猪猪侠带着超星卜卜和超星特工小队们穿梭在暗星域和空星域之间，寻找从内部击垮星盗的方法。

超星特工们团结一致，迎难而上，战胜一个个奇奇怪怪的赛车对手，捣毁雷帝斯布下的各种阴谋诡计，最后成功捣毁星盗集团，完成拯救超星宠萌的任务。

一段全新的星际赛车之旅就此展开，猪猪侠将快速集合车队伙伴，克服各式各样来自赛道环境、机械故障的困难，还要面对五花八门的竞争对手，以及抢夺超星卜卜的星际盗贼团们，开始正义的太空飞车啦！